Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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NFIAQ12857 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NFIAQ12857 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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