Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP18Q9UMW8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP18Q9UMW8 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP18Q9UMW8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
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