Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MEIS3Q99687 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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MEIS3Q99687 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MEIS3Q99687 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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