Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATG4CQ96DT6 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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ATG4CQ96DT6 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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ATG4CQ96DT6 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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ATG4CQ96DT6 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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ATG4CQ96DT6 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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ATG4CQ96DT6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ATG4CQ96DT6 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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