Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC47Q96A33 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC47Q96A33 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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