Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
UBXN4Q92575 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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UBXN4Q92575 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
UBXN4Q92575 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
UBXN4Q92575 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
UBXN4Q92575 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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