Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPROQ16827 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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PTPROQ16827 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPROQ16827 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPROQ16827 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPROQ16827 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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