Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
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RPE65Q16518 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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RPE65Q16518 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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RPE65Q16518 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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RPE65Q16518 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPE65Q16518 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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RPE65Q16518 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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RPE65Q16518 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPE65Q16518 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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