Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SURF1Q15526 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SURF1Q15526 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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