Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAPTM4AQ15012 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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