Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CKAP5Q14008 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CKAP5Q14008 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CKAP5Q14008 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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CKAP5Q14008 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP5Q14008 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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CKAP5Q14008 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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CKAP5Q14008 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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CKAP5Q14008 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP5Q14008 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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