Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SNX1Q13596 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SNX1Q13596 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SNX1Q13596 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX1Q13596 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX1Q13596 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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SNX1Q13596 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX1Q13596 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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SNX1Q13596 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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SNX1Q13596 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SNX1Q13596 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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