Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF4BQ13523 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF4BQ13523 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF4BQ13523 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms