Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LSAMPQ13449 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LSAMPQ13449 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LSAMPQ13449 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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