Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
AP3B2Q13367 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
AP3B2Q13367 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
AP3B2Q13367 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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