Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ERCC8Q13216 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ERCC8Q13216 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 339.6 ms