Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
BNIP3Q12983 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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BNIP3Q12983 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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BNIP3Q12983 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BNIP3Q12983 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
BNIP3Q12983 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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