Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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GTF3C1Q12789 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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