Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM4SF4P48230 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TM4SF4P48230 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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TM4SF4P48230 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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TM4SF4P48230 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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TM4SF4P48230 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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TM4SF4P48230 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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TM4SF4P48230 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TM4SF4P48230 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TM4SF4P48230 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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