Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATRXP46100 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ATRXP46100 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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