Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD3P31249 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD3P31249 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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