Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NPIPB7O75200 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NPIPB7O75200 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms