Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTIFO43310 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CTIFO43310 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CTIFO43310 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTIFO43310 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.3 ms