Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP4Q9P0V3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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