Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VGLL1Q99990 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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VGLL1Q99990 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VGLL1Q99990 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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