Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RAB3CQ96E17 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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RAB3CQ96E17 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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RAB3CQ96E17 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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RAB3CQ96E17 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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RAB3CQ96E17 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAB3CQ96E17 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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RAB3CQ96E17 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAB3CQ96E17 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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RAB3CQ96E17 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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