Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NLRC3Q7RTR2 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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