Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SNRNP35Q16560 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNRNP35Q16560 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SNRNP35Q16560 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.5 ms