Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
VAMP3Q15836 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
VAMP3Q15836 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
VAMP3Q15836 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.9 ms