Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
IRF4Q15306 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IRF4Q15306 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms