Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAB39AQ14964 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms