Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SQLEQ14534 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SQLEQ14534 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SQLEQ14534 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms