Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARF1Q14162 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARF1Q14162 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARF1Q14162 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARF1Q14162 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARF1Q14162 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCARF1Q14162 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCARF1Q14162 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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