Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL9A3Q14050 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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