Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATMQ13315 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATMQ13315 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATMQ13315 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
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