Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CLN3Q13286 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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