Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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FOXD4Q12950 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXD4Q12950 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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FOXD4Q12950 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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FOXD4Q12950 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
FOXD4Q12950 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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