Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CPSF1Q10570 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CPSF1Q10570 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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