Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
RBBP4Q09028 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RBBP4Q09028 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RBBP4Q09028 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms