Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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ERVPABLB-1P60509 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
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ERVPABLB-1P60509 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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ERVPABLB-1P60509 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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