Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXD13P35453 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXD13P35453 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD13P35453 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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