Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRDP23468 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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