Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN9O75954 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TSPAN9O75954 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms