Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LRRTM2O43300 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRTM2O43300 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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