Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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USP18Q9UMW8 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP18Q9UMW8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP18Q9UMW8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP18Q9UMW8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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USP18Q9UMW8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP18Q9UMW8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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USP18Q9UMW8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP18Q9UMW8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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