Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms