Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
UBXN4Q92575 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
UBXN4Q92575 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBXN4Q92575 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.5 ms