Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NLRC3Q7RTR2 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NLRC3Q7RTR2 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NLRC3Q7RTR2 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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