Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms