Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms